如抗甲状腺过氧化物酶抗体水平较高，提示可能存在自身免疫性甲状腺疾病。甲状腺过氧化物酶抗体是诊断桥本氏病的金标准，桥本氏甲状腺炎，此疾病可合并甲亢、甲减，临床上需根据甲状腺功能选择治疗方案：若合并甲亢，给予抗甲亢治疗；若合并甲减，给予优甲乐抗甲减治疗；若甲状腺功能正常：无甲亢、甲减者，动态观察，三个月到半年复查，根据甲功变化选择治疗方案。该项指标升高对家族甲状腺疾病的检测也具有一定的临床意义。
甲状腺过氧化物酶抗体是甲状腺微粒体的主要抗原成分，其功能与甲状腺素的合成有关。其与自身免疫性甲状腺疾病的发生、发展有密切关系，甲功正常而甲状腺过氧化物酶抗体阳性是未来发生甲减的危险因素。
