咽喉镜检查会有一些不舒服，可能有恶心、想呕吐的感觉，所以建议在空腹时进行，如果有义齿，医生会提醒病人摘除。检查时患者需全身放松，平静呼吸，与检查者密切合作。另外，做喉镜对咽喉部是一个刺激，因此，做完之后尽量不要嘶喊，大声说话或用力咳嗽。
人体的咽喉部是一个管腔状的结构，但是里面也是有很多复杂的结构和间隙，耳鼻喉科医生简单检查时所用的压舌板和间接喉镜，只能查见部分咽部和喉部的结构。很多深部的结构，比如说舌根和会厌间隙、梨状窝、喉室和声带等等，往往不能暴露检查清楚，这时候，就需要借助咽喉镜的帮助来完成了。
