胎儿畸形的发生原因包括：遗传因素、环境因素、食品、药物和病毒感染等。遗传因素中，染色体疾病是导致胎儿畸形最多的一类遗传性疾病。环境因素如噪音、辐射、接触有害的化学制剂与胎儿畸形密切相关，胎儿在母体内生长发育过程中暴露于有致畸物的环境中可导致功能紊乱和发育畸形。孕期病毒感染以及饲养宠物等所致弓形虫感染，是较常见的致畸生物因素。临床上一些药物也会对胎儿有害，导致其发育畸形。
