1、遗传因素：如果本身存在先天性遗传基因缺陷、染色体异常等问题时，就会增大发生胚胎停育的几率。常见的遗传基因缺陷问题有精子染色体异常或者卵子染色体异常。
2、子宫腔畸形：如果本身存在宫腔畸形问题，就可能影响到胚胎生长发育，从而引起胚胎停育。
3、孕期受到不良因素刺激：孕期受到某些病毒感染，接触有毒化学物质或者放射性物质，服用某些孕妇禁服药物，受到了高温、噪音或精神上的刺激等，都可能引起胚胎停育。
4、孕妇本身体质有营养不良、过度瘦弱，也可引发胚胎停育。
其次，患有全身性疾病疾病，如糖尿病、高血压、黄体功能不全、免疫功能异常等，都可成为胚胎停育的原因。
