真菌感染分为浅部真菌病、皮下真菌病和系统性真菌病。浅部真菌病主要包括头癣、体癣，股癣等浅表真菌感染。皮下真菌病是指真菌侵犯真皮、皮下组织和骨骼，主要包括孢子丝菌病、着色芽生菌病、暗色丝孢霉菌病和足菌肿。系统性真菌病，多是由条件致病菌引发。一般按照致病菌的名称命名，如曲霉病、念珠菌病、隐球菌病等。不同的病有相应的不同的症状。
