卵巢囊肿分为生理性囊肿以及病理性囊肿，是否做手术以及采用何种手术方式需要根据病情而定。
生理性囊肿一般不需要手术治疗，病理性囊肿如果术前考虑良性可能性大，则可以选择腹腔镜治疗，现在还可以通过阴道单孔腹腔镜来进行卵巢囊肿的手术。
如果怀疑有可能是卵巢癌，比如卵巢包块是实性、病人年龄比较大、比较消瘦，或同时伴有腹水、B超发现血运丰富等，另外查体时发现囊肿表面不平并固定在盆腔，或者是在做三合诊时发现子宫直肠窝有颗粒感，这种情况下可能要做开腹探查，尽量争取完整的肿瘤切除，这样能够尽量避免肿瘤扩散，带来相对更好的预后。
