女性停经40天一般是能看到孕囊的。正常女性的月经周期为28天,如果女性平均40天,说明有可能怀孕10天以上,这个时候,女性做B超就可以看到孕囊。根据个人体质不同,如果女性的月经周期超过30天来一次的话,这时女性停经40天,在做B超的时候,就有可能看不到孕囊,主要是由于怀孕的时间较短,孕囊还没有发育成熟。这时女性可以再等待大约一周左右的时间,在做B超的检测,基本就可以看到孕囊。如果还是看不到孕囊,可以到医院做血液的HCG检测来判断是不是怀孕。