胚胎停育的原因有胚胎因素、母体因素和环境因素，仅仅靠胎停两次不能确定是母体因素。胚胎停育常见的因素为胚胎染色体异常，占50%-60%。母体全身性疾病，如梅毒感染、流感病毒、巨细胞病毒、支原体、衣原体、弓形虫、单纯疱疹病毒等感染也可引起胚胎染色体畸变而导致胚胎停育。所以胚胎停育最多见于胚胎染色体异常。
