临床上根据患者血流动力学情况，将患者分为高危（合并休克或持续性低血压）和非高危（不伴休克或持续低血压）。高危患者住院期间死亡风险极高，尤其是入院后数小时。早期诊断、早期治疗有利于改善预后。对于非高危患者，抗凝治疗后多症状完全缓解，预后良好。但是0.1%-9.1%的患者可能出现慢性血栓栓塞性肺动脉高压。对于急性肺栓塞抗凝治疗3个月后仍合并呼吸困难、体力减退或右心衰竭的患者，需要评估是否存在慢性血栓栓塞性肺动脉高压，如确诊首选的治疗方法是肺动脉血栓内膜剥脱术和终生抗凝。
