试管婴儿胚胎停育的原因与自然妊娠胚胎停育的原因一样，需要针对病因防止胚胎停育。胚胎停育常见的胚胎因素有染色体异常，可以通过试管婴儿三代技术对胚胎进行筛查，若胚胎染色体异常则不移植。
胎停常见的母体因素有：
1、全身性疾病：全身感染，如梅毒螺旋体感染、巨细胞病毒、衣原体、弓形虫等均可导致胎停，需针对病因进行治疗，好转后再考虑妊娠。
2、免疫功能异常：如母儿血型不合、孕妇抗磷脂抗体产生过多等，需治疗转阴后再考虑妊娠。
3、不良习惯：过量吸烟、酗酒、吗啡、海洛因等毒品易可导致胎停，需戒烟、戒酒、戒毒后再考虑妊娠。
