卵巢囊肿的治疗方案取决于患者的年龄、囊肿类型和大小、患者的临床症状和是否出现并发症。偶然发现的无症状、体积较小的囊肿一般期待治疗，囊肿可能会自行消失，可适当辅助药物活血化瘀、消炎止痛，例如桂枝茯苓胶囊、止痛化癥等。如果卵巢囊肿持续存在并出现增大、扭转、破裂、感染等改变，需要及时手术治疗，但同时可采取药物辅助治疗，给予抗感染、止血等对症药物处理，也可以适当采用些中成药或中草药治疗。但单纯药物治疗很难彻底消除囊肿。
