扁平疣有可能自行消失，但概率较低且过程漫长，通常需数月甚至数年时间，且并非所有患者都能自愈。
扁平疣由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，其消退与人体免疫系统状态密切相关。当免疫功能较强时，身体可能通过产生抗体抑制病毒复制，逐步清除感染细胞，使疣体逐渐缩小直至消失，这种情况多见于青少年或免疫功能正常者，且疣体数量较少、体积较小时更易发生。
然而，多数患者因免疫功能不足或疣体数量较多、体积较大，难以依靠自身免疫力清除病毒，导致扁平疣长期存在。此外，扁平疣具有传染性，在等待自愈期间，可能通过密切接触或共用物品传播给家人或朋友，也可能在自身其他部位引发新的疣体。
因此，尽管扁平疣存在自行消退的可能性，但临床仍建议尽早干预。治疗方法包括外用维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等药物抑制病毒复制，或通过冷冻、激光等物理治疗直接去除疣体。对于反复发作或多发性扁平疣，还可采用免疫调节治疗增强机体抗病毒能力。治疗期间需保持皮肤清洁，避免搔抓疣体，防止自身接种传播，同时加强锻炼、均衡饮食以提高免疫力，降低复发风险。
