孕酮低的原因主要包括黄体功能不全、卵巢早衰、多囊卵巢综合征、甲状腺功能异常、高泌乳素血症、应激状态、营养不良、药物影响、胚胎发育异常和肾上腺功能失调。
黄体功能不全是导致孕酮低的最常见原因，黄体期孕酮分泌不足。卵巢早衰会导致卵巢功能减退，孕酮合成减少。多囊卵巢综合征患者常有排卵障碍，影响黄体形成和孕酮分泌。甲状腺功能异常无论是甲亢还是甲减都会影响性激素平衡。高泌乳素血症会抑制正常排卵和黄体功能。长期处于应激状态会使体内皮质醇水平升高，干扰孕酮合成。营养不良尤其是蛋白质和必需脂肪酸缺乏会影响激素合成。某些药物如促排卵药、避孕药等会影响内分泌系统。胚胎发育异常时滋养层细胞功能不足，孕酮分泌减少。肾上腺功能失调会导致皮质醇等激素分泌异常，间接影响孕酮水平。
孕酮低的女性应注意保持规律作息，避免过度劳累和精神紧张，均衡饮食保证营养充足，特别是富含蛋白质、维生素和矿物质的食物，避免接触有害物质和影响内分泌的药物，定期进行产前检查，遵医嘱进行必要的激素治疗，并及时处理可能影响孕酮水平的其他疾病。
