扁平疣主要与病毒感染有关，并没有特殊的药物可以完全治愈。口服的药物主要有调节免疫功能的药物以及抗病毒的药物等。
1、调节免疫功能的药物：扁平疣主要与病菌感染有关，容易引发皮肤的异常病理改变，当身体免疫力低下时，容易受到病菌感染从而引发皮肤的病理改变，可以在医生的指导下服用调节免疫功能的药物治疗，比如转移因子口服液等。
2、抗病毒的药物：对于扁平疣的患者在药物治疗方面可以结合抗病毒的药物治疗，比如阿昔洛韦或者更昔洛韦等，有助于控制病情的发展，促进恢复。
具体的药物服用需要在专业医师的指导下进行，在口服药物的同时也可以结合局部外用药物或者结合物理因子治疗的方法改善。主要在于缓解局部皮肤的症状，促进皮肤疣的脱落。后期要注意加强身体的锻炼和饮食营养，提高体质，有助于降低疾病的复发概率。
