灰指甲通常由皮肤癣菌感染所引起，多由手足癣直接传染导致，治疗主要以药物治疗为主，也可选用手术治疗及物理治疗。
灰指甲主要是由皮肤癣菌侵犯甲床、甲板所引起甲病变，其次为酵母菌和霉菌感染。皮肤癣菌包括红色毛癣菌、须癣毛癣菌、絮状表皮癣菌等。灰指甲具有传染性，主要传播途径为接触传播，常见于既往有足癣的患者。
治疗灰指甲的局部药物多选用阿莫罗芬、环吡酮胺等。但是因为指（趾）甲的特殊结构，使药物不能很好渗透至整个指甲，导致局部药物治疗的效果有限。所以大多还需要口服药物进行全身治疗，可选用特比萘芬、伊曲康唑、氟康唑等，可以更有效地抑制真菌的生长繁殖，从而有助于灰指甲的治疗。
灰指甲的手术治疗主要就是拔除病甲，常与药物治疗联合使用。另外还可选择激光治疗、光动力治疗、离子导入治疗等物理疗法，但是物理疗法效果不及口服抗真菌药物，仅作为辅助治疗或替代治疗。
