眼睛角膜炎的治疗原则为积极控制感染、减轻炎症反应、促进溃疡愈合、减少瘢痕形成。
细菌性角膜炎宜选用敏感的抗生素进行治疗。真菌性角膜炎需使用抗真菌药物治疗。病毒性角膜炎可使用抗病毒药物，防止复发也是病毒性角膜炎治疗的重点，临床尚无防复发特效药。
主要靠激素滴眼液、免疫抑制剂滴眼液，如环孢素滴眼液及他克莫司滴眼液等。激素滴眼液的使用需要严格掌握适应证，使用不当可致病情恶化，甚至角膜穿孔致盲。
在积极抗感染、抗炎的基础上，局部使用胶原酶抑制剂，如依地酸二钠、半胱氨酸等抑制溃疡发展。口服大剂量维生素C、维生素B，有助于溃疡愈合。还可以使用促进角膜上皮生长的药物。
细菌性角膜炎急性期不宜使用激素滴眼液，慢性期病灶愈合后可酌情使用激素减少角膜瘢痕形成。真菌性角膜炎禁用激素。单纯疱疹病毒性角膜炎出现角膜上皮损伤时不可用激素。
