如果是在正规医院做的肠镜，通常都不会导致交叉感染的情况出现，医院对消化内镜的清洗消毒都非常严格，完全可以预防交叉感染的发生。
医院在对患者进行肠镜前也会先进行传染性指标的常规检查，当得到阴性的检查结果后，才会继续进行下一步的操作。而针对阳性患者，医院则会将使用过的检查器具通过特殊的方法进行消毒。这样就能够在最大程度上减少交叉感染出现的几率。
正规医院还会将肠镜检查等所涉及使用过的一次性用品进行回收处理，而且非一次性的用具，比如操作台、操作室也会进行严格的消毒灭菌。所以只要消毒措施完善，通常都不会造成交叉感染，不用过于担心。
