会厌囊肿通常自己不会消退，没有伴随性症状通常不需要治疗，定期到医院做动态复查即可。
会厌囊肿主要是由于会厌部黏膜腺细胞堵塞在毛囊口，导致腺体无法正常分泌而引起的疾病。会厌囊肿体积较小时没有明显的症状表现，有部分患者仅是感觉到轻度瘙痒等，可暂时性进行动态观察，确定囊肿是否有增大趋势。
如果会厌囊肿持续性增大，或者是导致咽喉部有剧烈的异物感、疼痛感，影响到正常的吞咽功能，需要做支撑喉镜下会厌囊肿摘除术。术后则需要谨遵医嘱服用左氧氟沙星等抗生素类药物，缓解感染性症状，避免会厌部出现急性充血、水肿等。
