溃疡性结肠炎3个月的癌变率极低，公认溃疡性结肠炎并发结肠癌的机会要比同年龄、同性别正常人群高。但是直肠乙状结肠癌多见于病变范围广，患病时间长的患者，例如全结肠炎患者、病程超过10年以上的患者，发生结肠癌的危险性比普通人群高10-20倍。
结肠癌在癌变在静止期，由于经常便血、腹泻被患者认为结肠炎复发，因此明确结肠癌诊断时存在延迟，预后比活动性溃疡性结肠炎发生癌变预后更差。结肠镜检查至少要每两年进行一次，并且应该进行多部位活检。溃疡性结肠炎癌变监测应是对于病程8-10年以上的长期患者，病变范围较广泛或全结肠炎以及病程在30-40年以上，局限性左半结肠炎、直肠乙状结肠炎患者进行监测。
当组织出现异常增生时，例如不典型增生，需要更加密切的短期内随访，重度异型增生如果可以确诊，应当进行手术治疗。
