肠瘘患者的治疗并不能一概而论，需要视情况而定，具体如下：
在肠瘘早期，如引流不畅，在进行剖腹探查时，应用大量生理盐水冲洗腹腔，并作多处引流，或扩大瘘口以利于引流。在治疗过程中，严密观察有无新的腹腔脓肿形成，如果肠外瘘患者出现继发感染，则还需要在医生指导下进行药物抗感染治疗，比如头孢哌酮钠、头孢呋辛钠等等；同时还需要应用全胃肠外营养，以达到正氮平衡。
如果患者是由于外伤、剧烈撞击等急性损伤导致的肠瘘，此时需要立即进行急诊手术，通过手术将肠瘘切除、缝合。
如果患者的肠瘘病情呈慢性过程，由于其通常可能存在炎症、水肿、感染等情况，所以需要进行相应的抗炎、引流等措施，待全身症状得到改善后，再考虑采取手术治疗，大概需要在肠瘘发生后的3-6个月才能进行手术。
