婴儿肠炎的治疗主要是完善相关检查，积极进行对症治疗，必要时抗感染治疗，预防并发症，加强护理。
- 婴儿肠炎建议完善大便常规、隐血、轮状病毒抗原、血常规、C-反应蛋白以及大便培养等相关检查，明确病因。比较常见的原因是病毒感染，尤其是轮状病毒、诺如病毒感染，大部分具有自限性，主要是进行对症治疗，改善症状，建议在医师指导下服用双歧杆菌四联活菌片、地衣芽孢杆菌活菌胶囊、复方嗜酸乳杆菌片、蒙脱石散等。
- 但是如果大便中有比较多的白细胞、脓白细胞以及吞噬细胞，需要考虑细菌感染，建议在医师指导下使用抗生素进行治疗，比如头孢克肟颗粒、头孢地尼分散片等。还需要遵医嘱服用口服补液盐Ⅲ，预防脱水等并发症。
婴儿肠炎需要注意加强臀部护理，保持清洁卫生以及干燥，降低发生红臀的概率。
