3个月宝宝早上起来咳嗽的原因主要包括刺激性咳嗽、呼吸道感染和过敏性咳嗽，需要具体问题具体分析。
由于卧室空间比较小，并且晚上处于关门关窗的状态，会导致空气湿度下降，环境比较干燥，并且早晨气温低，可能会刺激呼吸道，导致宝宝出现刺激性咳嗽。家长要及时调整室内的温度、湿度，给孩子提供良好的休息环境，保持呼吸道湿润，能够缓解咳嗽症状。
由于受到病原体感染，导致呼吸道分泌物增加，人体平躺状态容易引起鼻后滴漏，呼吸道分泌物聚集在咽部，所以宝宝早上起来会出现咳嗽症状。对于这种情况，可以给宝宝服用氨溴特罗口服溶液、盐酸氨溴索口服溶液。
宝宝早上起来呼吸道吸入粉尘，花粉或者由于接触被褥中的尘螨，机体会产生过敏反应，所以会出现过敏性咳嗽。可以遵医嘱给宝宝应用抗组胺类的药物，比如盐酸西替利嗪、布地奈德等。
