肺结核痰涂片阳性的患者至少需要使用4-6个月以上的抗结核药物，甚至达到9个月的治疗时间。肺结核病的治疗原则是：早期、规律、全程、适量、联合。整个治疗方案分为强化与巩固两个阶段。
- 初次的肺结核病，无论是痰菌阳性还是阴性，强化治疗2个月，常用的药物有：异烟肼、利福平、乙胺丁醇、吡嗪酰胺。巩固期4个月，药物有：异烟肼、利福平，可以每天用药，最好是早上空腹后睡前空腹。也可以间隙性用药方法，如：隔日一次或每周服用3次。
- 复治痰菌阳性肺结核的治疗方案：每天用药方案的强化期：异烟肼、利福平、乙胺丁醇、吡嗪酰胺、链霉素，每天一次，连续2个月。巩固期：异烟肼、利福平、乙胺丁醇联合使用，每天一次，连续6-10个月，在4个月时痰菌仍阳性，则要延迟6-10个月的治疗时间。
间隙用药方案的强化期：异烟肼、利福平、乙胺丁醇、吡嗪酰胺、链霉素隔日或每周3次用药，连续2个月。巩固期：异烟肼、利福平、乙胺丁醇，隔日或每周3次，连续6个月。用药方案需要在结核专科医生检查后确定和尊重患者用药意愿来执行，但必须要坚持用药，避免间断用药或漏服药物，以免影响治疗效果。
