慢性肾衰竭肾性骨病的主要病因有肾脏自身的病变、严重感染、药物性致肾衰竭或者高血压、糖尿病。
这类引发的肾衰竭约占慢性肾功能衰竭的百分之七十以上。如各类慢性肾小球肾炎，肾病综合征，慢性间质性肾炎、肾结石、肾囊肿、肾动脉狭窄、肾小管酸中毒等。
各种严重感染同样是肾衰竭的原因，特别伴败血症者可通过肾缺血和肾毒性机制诱发。
对多位肾衰竭患者的调查中发现，肾毒性药物运用不当对肾脏的长期损害，积累达到一定程度后出现肾衰竭。比如说止痛片，止痛片中含有非那西丁，长期的服用不断损伤肾脏，引起慢性间质性肾炎，继而发展到肾衰竭；除此之外，像庆大霉素等药物运用不当也会引起肾衰竭。
高血压和糖尿病都极易引发肾脏病变，血糖血压应时常监测，将其控制在正常范围。血压、血糖长期过高都会造成血管硬化而使肾脏受损，因为肾脏就是由数百万个微血管球组成。怀孕的女性肾脏负担会加重，应注意监测肾功能，以免因妊娠毒血症而变成尿毒症。
