肾感染的治疗最好是做细菌培养加药敏检查，根据药敏结果来选择细菌敏感、有效的抗生素治疗。要慎重选择有肾毒性的药物。
如：头孢类消炎药中的头孢唑林钠；氨基甙类消炎药，如：庆大霉素、丁胺卡那霉素等药物，优先选择青霉素和头孢类，如：头孢氨苄青霉素、普鲁卡因青霉素、头孢曲松、头孢呋辛、头孢他啶等药物，但不能自己擅自盲目使用抗生素，以免加重肾毒性反应，促进肾功能损伤等。
肾炎有很多类型，有急性、慢性肾小球肾炎、肾盂肾炎、急进性肾小球肾炎、肾病综合征等不同的肾病问题。
- 急性肾小球肾炎的治疗主要是对症、消除蛋白尿和血尿，如果是细菌感染性所致，需要及时抗生素治疗，尽量不使用有肾毒性的抗菌药物，经过抗菌和对症治疗后绝大多数可以恢复正常。
- 慢性肾炎的治疗非常棘手，需要根据肾炎的病理类型和蛋白尿、血尿、肾功能损害程度不同来调整用药治疗方案。
- 肾盂肾炎，是细菌感染性肾病，关键的治疗是做尿液细菌培养和药敏检查，根据药敏结果来选择敏感的抗生素治疗，治疗后是可以完全恢复正常，不容易再复发。
- 急进性肾小球肾炎的治疗主要是针对病因和对症治疗处理，消除水肿和蛋白尿、控制血压等是基础措施，出现急性肾损伤后需要及时血透治疗。
- 肾病综合征的治疗也是一个漫长的阶段，以对症治疗为主。
