蛋白粉对肾脏有一定的负担，不过在肾脏功能正常的情况下适量进食蛋白粉影响不明显，大剂量进食蛋白粉或肾脏功能受损的情况下进食蛋白粉影响比较显著。
肾脏是人体内最大的排泄器官，通过排尿的过程排出大量的代谢废物，绝大多数食物、药物，包括保健品进入体后，最终产生的代谢废物都需要通过肾脏排出。蛋白粉进入体内后，经过一系列代谢过程，会产生大量的肌酐或尿素氮等有害化学物质，这些化学物质都需要通过肾脏排泄，所以会增加肾脏的负担。
- 如果肾脏没有器质性疾病，肾脏的排泄功能正常，则具有比较强大的代偿作用，进食蛋白粉后产生的肌酐和尿素氮等代谢废物可以通过排尿的过程正常排出，没有大的影响。肾脏功能正常，但进食蛋白粉的剂量过大，则会使肾脏负担加重，长期以往容易引起肾功能衰竭。
- 如果本身患有肾小球肾炎或肾病综合征等肾脏慢性疾病，肾脏的代偿功能减弱或丧失，不能有效排出体内的代谢废物，进食蛋白粉后随着体内的尿素氮和肌酐浓度增高，可能会诱发肾功能衰竭，或者使原有的肾功能衰竭加重。
