一般情况下，盆腔子宫内膜异位症的诊断方法如下：
医生会询问患者是否有痛经并且进行性加重的情况，是否有性生活时疼痛，以及与月经周期相关的排便痛、血尿或尿痛等，是否有不孕或者慢性盆腔疼痛。
双合诊检查时子宫可能会有后倾、固定、活动差。有时在附件区会有囊性不活动包块，双合诊及三合诊触及盆腔或者后穹窿内有触痛结节。
主要用于诊断卵巢子宫内膜异位囊肿或者子宫腺肌病。超声检查可提示一侧或双侧卵巢囊肿，囊内有细小的絮状光点时有强回声，常常与子宫粘连，两者界限不清。或者是子宫增大，肌壁增厚，回声不均。
对于卵巢子宫内膜异位深处浸润型病变有诊断和治疗评估价值，但费用昂贵，不作为初选的诊断方法。
是诊断盆腔子宫内膜异位症的最佳方法。通过腹腔镜可直视盆腔子宫内膜异位病灶，表现为囊肿、局部隆起的结节或紫蓝色斑点，盆腔粘连等。另外，可在腹腔镜下进行活检并确定临床分期，目前最新指南推荐基于临床诊断尽早开始经验性药物治疗。
