肝细胞腺瘤可能是因为雌激素的作用造成的，也可能与雄激素有关，或者代谢障碍、遗传、肥胖、糖原贮积症有关。
女性患者患肝细胞腺瘤，大部分都与雌激素的作用有关，尤其是服用避孕药、单方雌激素类药物，导致体内雌激素水平明显升高时，有可能因为增加了肝细胞的代谢负担，影响了其代谢功能，而诱发肝细胞腺瘤。
男性长时间服用外源性的雄激素，也有可能引发肝细胞腺瘤。患肥胖症及代谢综合征的患者，肝细胞内脂肪沉积过多，有可能诱发肝细胞腺癌。
患有家族性腺瘤性息肉病的患者，主要是腺瘤性息肉累及肝脏而引起的肝细胞腺瘤。糖原贮积病的患者，肝脏代谢负担比较大，有可能引起肝细胞腺瘤。
