咽喉反流和慢性咽炎大多数可以通过临床症状区分，也可以通过治疗方法区分。
咽喉反流可能会有消化道不舒服的症状，比如打嗝、反酸、腹泻、便秘等，可能会导致咽喉部位黏膜充血、咽部异物感、烧灼感、梗阻感、咽干、痛等症状。慢性咽炎可能是急性咽炎反复发作或治疗不彻底引起，咽喉部位会有疼痛、干燥、多痰等表现，也会有些人感觉咽喉部位有发紧的症状，所以这两种疾病在症状上有一定的差别。
咽喉反流需要在医生指导下服用抑制胃酸分泌的药物治疗，来帮助疾病恢复。慢性咽炎一般需要服用一些中成药或细菌溶解产物药物控制慢性感染，来帮助疾病恢复。
