输尿管结石的好发部位，主要在于输尿管的三处生理性狭窄。
输尿管左右各一条，连接肾脏和膀胱，有三处生理性狭窄，分别为：肾盂与输尿管移行处（输尿管起始处），输尿管和髂血管交叉部位，也就是越过小骨盆入口处，最后一个在进入膀胱壁的内部，也就是输尿管与膀胱连接部位。
由于大多数输尿管结石为继发性结石，由肾结石脱离后，掉入输尿管形成。在结石下排过程中，容易停留、嵌顿在三处生理狭窄处。所以，这三处也是输尿管结石的好发部位。如果结石可以顺利通过是三处生理性狭窄，掉入膀胱内，由于尿道直径大于输尿管直径，所以，这类结石基本可以自己排出。
