慢性呼吸衰竭的预后通常不佳，无法完全治愈。
在临床上，慢性呼吸衰竭是各种疾病所导致的一种最终结果，气道阻塞可以引起呼吸衰竭；肺部组织的病变如严重的肺结核、肺气肿、肺大泡可以引起呼吸衰竭；心脏的疾病，如严重的心律失常和心衰等疾病也可以引起慢性呼吸衰竭；脑血管疾病、脑外伤和脊髓的损伤也可以引起慢性呼吸衰竭；所以慢性呼吸衰竭并不是由于某种疾病所导致，而是由于多种原因所导致的一种最终结果。
而这些原因通常都不太容易治疗，如肺气肿所引起的慢性呼吸衰竭通常预后不佳，患者需要常年吸氧，并且在必要时还需要通过雾化以及其他抗感染药物来治疗慢性呼吸衰竭，所以通常预后不佳。
