巴雷特食管要根据患者的情况选择药物治疗、手术治疗，同时注意饮食。
- 如果患者症状较轻，没有癌变，可对症使用药物治疗，如有反酸、烧心等胃食管反流症状的患者可使用抑酸剂、促动力药、胃黏膜保护剂治疗，常用药物有奥美拉唑、兰索拉唑、雷贝拉唑、多潘立酮、莫沙必利、西沙必利、硫糖铝等。
- 如果患者已经出现严重的异型增生或者已经发生癌变时，可以通过手术切除已经病变的组织，然后再重建食道。
- 另外，巴雷特食管的患者应注意合理膳食，多补充维生素。不吃生冷、油腻、煎炸、腌制和辛辣等刺激性食物，不喝酒、浓茶和咖啡及碳酸饮料，不吃过酸过甜等重口味食物，以及过烫的食物。
