功能性消化不良有一定的自愈倾向，并不是一直会发作。
病人往往有一定的发作性，如果患者精神状态很好，没有什么明显的诱因，情绪、饮食、环境、工作等都很顺利，可能就不会发作。但是有的人就会反复的发作，与内因和外因结合有关系。
对于反复发作的患者，可以通过吃药来解决。有的人其实不需要吃药，主要梳理一下心情，给一些心理的疏导就能解决问题。
如果患者症状持续不缓解，可以给予一些缓解焦虑的药物来改善患者症状，适当的进行一些瑜伽、太极的锻炼都有利于缓解症状。对于腹泻或者便秘，也可以采用一些药物来进行对症治疗，具体用药需要前往门诊就诊。
