滴虫性阴道炎主要是口服抗厌氧菌类抗生素，以及阴道局部上药治疗。
由于滴虫阴道炎不仅寄存于阴道内，还有可能隐藏于女性泌尿道下段或者宫颈腺体内。滴虫阴道炎感染后，除了外用阴道栓剂和阴部洗液治疗，建议配合口服抗厌氧菌药进行全身治疗。如果有性生活的女性，建议与性伴侣同治，避免阴道炎交叉感染。
滴虫阴道炎治疗期间禁止有性生活，除了配合药物治疗，日常也要注意保持卫生情况。每天要清洗私处，穿过的内裤可以用开水煮沸消毒，阳光下晾晒衣物，避免潮湿阴暗的环境滋生病菌。
