早上起床后肝区隐隐作痛，应根据情况选择彩超、腹部CT、肝功能等相关检查。
针对肝区隐隐作痛的情况，应结合患者的具体查体、病史等，给予的检查有肝功能、乙肝5项、肿瘤标志物、肝胆胰脾双肾彩超、上腹部CT、肝脏核磁、泌尿系彩超、消化道造影、胃肠镜等等。了解患者是否存在肝胆系统疾病、泌尿系统疾病、心血管系统疾病等。
以及有无右上腹疼痛、腰背部叩击痛等查体，并根据其初步检查的情况，必要时再次选择其他必要的辅助检查，来明确导致肝区隐隐作痛的病因。然后根据导致肝区隐隐作痛的具体病因，给予相应的治疗缓解临床症状。
