绝大部分胃食管反流病能治好，个别胃食管反流病预后不良。
胃食管反流病属可逆性疾病，如果能够做到早发现、早治疗，大部分食管反流病预后良好。但如果漏诊此病或者不重视此病导致治疗不及时，会出现胃食管反流引起的各种并发症，甚至导致死亡，包括食管出血、狭窄、食管癌、贲门癌、咽喉癌、肺癌，诱发睡眠呼吸暂停、喉痉挛、哮喘发作、心律失常、心绞痛发作甚至心梗可能。
胃食管反流病的治疗主要是药物治疗和一般治疗，严重患者要采取内镜或腹腔镜手术等微创治疗。药物治疗包括抑酸药雷贝拉唑和促胃动力药西尼必利等。
一般治疗包括清淡饮食、少食多餐，限制热量摄入，保持大便通畅，适量运动、保持正常体重。睡前避免进食食物，睡觉时抬高床头，避免发生反流等。
