肾结石按病因分类，主要分为草酸钙结石、磷酸钙结石、磷酸铵镁结石、尿酸盐结石等。
肾结石的发生，主要是由于尿液中的成分形成结石沉积在肾脏内，从而导致病变发生。由于发病原因不同，所以结石成分有所不同。
草酸钙结石以及尿酸盐结石这两种病变的发生，和患者代谢异常存在关系，由于饮食结构以及身体状况不同，从而导致结石病变发生。
磷酸钙结石的发生和尿路感染、尿路梗阻等情况相关，由于细菌可能将尿素分解为氨，使尿液变成碱性，有利于磷酸盐、碳酸盐沉积，从而形成结石。
磷酸铵镁结石的发生，和患者长期用药存在一定关系，例如：氨苯蝶啶、硅酸盐、磺胺类药物等。
