类风湿性关节炎主要影响的是四肢的小关节，比如腕部、手指、踝部、脚趾关节出现疼痛或者是肿胀，肩、肘、膝这些大关节也常有症状。疾病后期还会出现一些关节的变形。
而强直性脊柱炎主要影响的是脊柱和骶髂关节，表现为下腰背部和臀部的疼痛，夜间明显，翻身困难，早晨起床以后有腰部僵直、活动受限的情况。
另外，类风湿性关节炎的患者在化验风湿因子的时候大部分呈阳性，而强直性脊柱炎的类风湿因子为阴性，HLA-B27基因的阳性率高。两种疾病在关节超声、X线、CT和磁共振上的表现也不相同。这些化验检查也是区分两种病的重要指标。
