治疗胃食管反流主要使用胃底折叠术，近年来出现胃镜下胃底折叠术、腹腔镜下胃底折叠术都是经过改良后的手术方式，均是微创手术。射频消融也逐渐被广泛采用。
胃底折叠术是一种很经典的手术方法，能够很好的治愈胃食管反流。经过医学技术的发展，胃底折叠术也逐渐进步，以前是需要开胸、开腹的，后来逐渐出现了胃镜下胃底折叠术、腹腔镜下胃底折叠术等，对患者伤害大大减少，恢复时间也明显缩短。如今大部分医院都可以使用微创手术。
胃镜下射频消融是通过解决贲门松弛的问题，从而使食管反流好转。
