非角化型鼻咽癌的晚期症状有重度鼻塞、眼部症状、咽喉症状、远处转移病灶症状。
非角化型鼻咽癌晚期，肿瘤增长较快，堵塞后鼻孔，会出现一侧重度鼻塞或双侧鼻塞。
非角化型鼻咽癌晚期侵犯眼眶或与眼球相关的神经时，会出现复视、视物模糊、睑下垂、眼球固定、失明、瞳孔缩小、眼外肌麻痹等症状。
肿瘤如果累及脑神经或颈交感神经时会出现吞咽困难、声音嘶哑、舌半侧瘫痪和萎缩等咽喉麻痹症状。
非角化型鼻咽癌晚期发生骨转移时局部出现固定的疼痛和压痛。发生肺转移时会出现咳嗽、胸痛、痰中带血等症状。发生肝转移时主要症状为肝区疼痛。
