对于甲状腺结节的鉴别诊断，主要应该和一些颈部肿块疾病相鉴别。
- 首先，对于甲状腺结节应该明确为何种病理性质，常见的有结节性甲状腺肿、各种类型的甲状腺良性肿瘤以及甲状腺癌。其鉴别的主要方法是给予甲状腺结节的穿刺活检来明确诊断。
- 其次，对于一些其他的颈部肿块性疾病，如急慢性淋巴结炎、甲状舌管囊肿、脂肪瘤、纤维瘤、颈部恶性肿瘤（如淋巴瘤、转移性肿瘤）等等。而主要鉴别方法是给予彩超、颈部CT、颈部核磁等相关检查，做出初步的判断。
而对于鉴别有一定困难的疾病，则需要给予病变部位的穿刺活检，明确病理性质后作出鉴别。
