甲亢变甲减是否永久要根据原发病的情况来评估。
甲亢变甲减是永久的情况，主要包括甲状腺功能亢进，以及甲状腺癌和甲状腺自主高功能腺瘤，经过手术治疗以及放射性碘131治疗后，因为过多的甲状腺组织和肿瘤被切除后导致的继发性甲状腺功能减退，这种情况是永久的，因为甲状腺组织是不可再生组织。
甲亢变甲减是一过性的情况，主要见于亚急性甲状腺炎，这通常是一种当机体被病毒感染之后导致的甲状腺的炎症，此时首先会出现破坏性甲状腺毒症，引起甲亢，当甲状腺毒症消失时又变成甲减，而当炎症恢复后，通常甲状腺功能又会变为正常，不会遗留永久甲减。
