急性肾盂肾炎可能会复发。
急性肾盂肾炎的复发与多种因素有关，例如患者有复杂型的尿路畸形时，可能会导致肾盂肾炎反复。也有一部分患者在早期用药时，症状有所改善即停止用药，由于病情并未得到良好控制，因此容易引起复发。
此外，对于慢性盆腔炎、慢性肠炎、腹腔内感染者，也有可能会导致急性肾盂肾炎复发。
若无结构异常，单纯的急性肾盂肾炎可达到治愈目的。但对于反复发生的急性肾盂肾炎，则有可能会造成局灶性的瘢痕，影响肾脏的功能。对于急性肾盂肾炎高危的人群，需要每年定期进行体检复查。
