继发性失眠容易与原发性失眠相混淆。
继发性失眠和原发性失眠的表现都是睡眠障碍，既表现为入睡困难、睡眠维持障碍、睡眠质量降低、早醒等症状，并影响日间活动。但是引起失眠的原因不同，治疗方法也有所不同。
近年来国内外各大失眠指南都认为应该将失眠诊断为“失眠”和“共病失眠”，而后者指的是和其他疾病一起存在的失眠，包括了原来的继发性失眠。所以目前不再区分原发性失眠和继发性失眠，主要是诊断出失眠和共病失眠。
共病失眠可以是失眠合并存在有其他的疾病，比如说合并有焦虑抑郁等精神障碍，合并有心肺疾病，合并有不宁腿综合征、发作性睡病、睡眠呼吸暂停综合征等等。以上疾病都需要鉴别诊断。
