病毒性角膜炎会反复发作，患者通常需要长期间歇性的治疗，并没有准确的恢复时间。大多数的患者在用药2-4周后，症状可逐渐改善。
病毒性角膜炎即使在恢复后，由于病毒长期潜伏在神经内，患者受到各种因素引起免疫力低下时，病毒可能会通过神经，继续对角膜造成浸润和侵害，导致病毒性角膜炎再次发生。且此种因素也是导致病毒性角膜炎，需要长期间歇性治疗的主要原因。
病毒性角膜炎虽然不能治愈，但大多数的患者通过有效治疗后，症状可逐渐好转。如果患者失于治疗，则有可能会导致视力受到不可逆转的损伤，严重者有可能会产生失明。
