单纯性小体积肾囊肿一般不严重，可以随诊观察，较大的肾囊肿或多发性肾囊肿或者囊性肾癌则比较严重。
肾囊肿的严重程度一般和囊肿的病理类型、囊肿大小相关。体积较小的单纯性肾囊肿，一般不会对患者的身体健康造成影响；
多发性肾囊肿或多囊肾，由于数量较多可能会对肾脏造成明显压迫，使肾脏组织压迫萎缩、肾脏失去正常生理功能。若多发性肾囊肿长期压迫肾脏，可能会引起肾脏衰竭最终形成尿毒症；
囊性肾癌则是恶性病变，这种情况会对患者身体健康造成严重影响，则需要早期手术治疗。
