小儿先天消化道畸形是一类先天性疾病，是由于消化道发育不良所导致。
小儿先天消化道畸形可能会出现在消化道的任何部位，其中食管、幽门、胃、结肠等，是比较常见的畸形部位。消化道畸形会对患者产生很大的身体危害，轻者可能会导致患者吐奶、排便异常等，较为严重的则会导致消化道完全梗阻、呼吸窘迫等，严重影响生长发育。消化道畸形最好的治疗方式为手术治疗，现在也有很多轻症患者会采用腹腔镜手术的方式进行治疗，提高患者的术后恢复速度。
小儿先天消化道畸形患者多身体虚弱，在手术前后都需要使用特殊肠内营养制剂进行营养支持。
