溶栓治疗大部分都是有效果的，主要适合高危的动脉血栓肺栓塞的患者有明显呼吸困难、胸痛和低氧血症。
对于部分中危的动脉血栓栓塞的患者没有禁忌证，也可以考虑溶栓治疗。溶栓的时间窗口期一般在14天之内，若近期有新发生的肺动脉血栓，可适当延长，有明确溶栓指征的患者应尽早开始溶栓治疗。
溶栓治疗的禁忌证，包括有活动出血、近期有颅内出血、两周内有大手术、有分娩以及有创的检查等。对于难以控制的高血压、有缺血性的脑卒中疾病、有创伤性的心肺复苏、血小板计数低于正常值的患者都是不能做溶栓治疗。
