难治性肾病综合征是比较严重的，主要体现在治疗方面和疾病并发症方面。
难治性肾病综合征患者的病程一般较长，多数对激素等不敏感，即使加用免疫抑制剂也不能起到应有的治疗效果，会引起全身水肿等临床症状持续加重。
另一方面，难治性肾病综合征由于免疫力下降，极其容易并发各种感染。还会因为血液系统发生改变，容易形成血栓，引发脑梗塞、心肌梗塞等严重疾病。
另外，难治性肾病综合征患者由于长期治疗无效，会导致肾功能持续下降，最终发展至肾功能衰竭的状态。
