慢性牙周炎的治疗一般分为四个阶段，包括牙周基础治疗、手术治疗、修复治疗和维护治疗。
基础治疗首先教育并指导患者自我控制菌斑的方法，如建立正确的刷牙方法和习惯，使用牙线、间隙刷等辅助工具保持口腔卫生等；去除病因，使用专用的龈上洁治器械和龈下刮治器械彻底的清除牙结石、控制菌斑，根面平整，必要时调整咬合、消除食物嵌塞和纠正不良修复体等、松牙固定。
在经上述治疗如果病情仍不能控制或有明显的急性炎症以及对某些重症患者，可辅以全身药物治疗，对于有基础疾病患者如糖尿病等还应配合控制血糖。
基础治疗后如果仍有5mm以上的牙周袋，且探诊仍有出血，或牙龈及骨形态不良、膜龈关系不正常时，则一般均需进行手术治疗。牙周手术后2—3个月后可对口内余留牙齿进行相应的修复治疗。
第四阶段牙周支持治疗，也称维护期，它是牙周疗效得以长期保持的先决条件，牙周病患者需要定期维护，定期复查，目的是使牙周炎处于静止期。
